DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群

作者: 付小花 [1,3] ; 李艳丽 [2] ; 乐毅全 [1] ; 王磊 [1]

关键词: 优势菌群定量检测 DGGE 定量PCR(qPCR)

摘要：精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义。该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR（qPCR）技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量。方法：抽提样品DNA,针对16SrDNA进行PCR-DGGE分析,明确样品中的优势菌群;再根据特定优势菌群的基因序列设计适合的定量引物,通过针对特定优势菌群的定量PCR分析,得到样品中优势菌群的数量信息。该方法灵敏度高、重复性好,并且无需培养,最大限度地保持了样品原始群落信息。

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DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群

作者: 付小花 [1,3] ; 李艳丽 [2] ; 乐毅全 [1] ; 王磊 [1]

关键词: 优势菌群 定量检测 DGGE 定量PCR(qPCR)

关键词: 优势菌群定量检测 DGGE 定量PCR(qPCR)